國家曾經(jīng)對建筑業(yè)個(gè)人所得稅進(jìn)行明確，由總機(jī)構(gòu)全額申報(bào)個(gè)稅的，工程所在地不能在核定征收個(gè)稅，但實(shí)際落實(shí)不到位。不同地區(qū)稅務(wù)機(jī)關(guān)對建筑企業(yè)員工個(gè)人所得稅征收管理可能不同，一些地方照樣要求按照收入額的一定比例代征個(gè)人所得稅。

根據(jù)國家稅務(wù)總局公告2015年第52號文的規(guī)定，自2015年9月1日起，按以下方式操作：

1. 總承包企業(yè)、分承包企業(yè)派駐跨省異地工程項(xiàng)目的管理人員、技術(shù)人員和其他工作人員在異地工作期間的工資、薪金所得個(gè)人所得稅，由總承包企業(yè)、分承包企業(yè)依法代扣代繳并向工程作業(yè)所在地稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)繳納?？偝邪髽I(yè)和分承包企業(yè)通過勞務(wù)派遣公司聘用勞務(wù)人員跨省異地工作期間的工資、薪金所得個(gè)人所得稅，由勞務(wù)派遣公司依法代扣代繳并向工程作業(yè)所在地稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)繳納。

2. 跨省異地施工單位應(yīng)就其所支付的工程作業(yè)人員工資、薪金所得，向工程作業(yè)所在地稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理全員全額扣繳明細(xì)申報(bào)。凡實(shí)行全員全額扣繳明細(xì)申報(bào)的，工程作業(yè)所在地稅務(wù)機(jī)關(guān)不得核定征收個(gè)人所得稅。

3. 總承包企業(yè)、分承包企業(yè)和勞務(wù)派遣公司機(jī)構(gòu)所在地稅務(wù)機(jī)關(guān)需 要掌握異地工程作業(yè)人員工資、薪金所得個(gè)人所得稅繳納情況的，工程作業(yè)所在地稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)及時(shí)提供?？偝邪髽I(yè)、分承包企業(yè)和勞務(wù)派遣公司機(jī)構(gòu)所在地稅務(wù)機(jī)關(guān)不得對異地工程作業(yè)人員已納稅工資、薪金所得重復(fù)征稅。兩地稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)加強(qiáng)溝通協(xié)調(diào)，切實(shí)維護(hù)納稅人權(quán)益。

但實(shí)際操作中，通常涉及兩次個(gè)人所得稅，一是項(xiàng)目所在地，由項(xiàng)目所在地稅務(wù)機(jī)關(guān)直接按照工程額的一定比例扣繳個(gè)人所得稅，二是機(jī)構(gòu)所在地，按照實(shí)際發(fā)放的工資薪金，據(jù)實(shí)按照“工資薪金所得”申報(bào)繳納個(gè)人所得稅，且多數(shù)稅務(wù)機(jī)關(guān)實(shí)際執(zhí)行時(shí)，也不予扣除。

貴公司如果已經(jīng)按照國家稅務(wù)總局公告2015年第52號文的規(guī)定操作，不存在稅務(wù)風(fēng)險(xiǎn)，如果沒有，應(yīng)及時(shí)了解當(dāng)?shù)刂鞴芏悇?wù)機(jī)關(guān)的操作要求，按規(guī)定補(bǔ)充申報(bào)，避免日后的罰款（或者滯納金）。