不會(huì)出現(xiàn)一票兩抵，選用簡(jiǎn)易計(jì)稅方式的，扣除分包款后納稅，其取得專票不能抵扣；貴公司選用的一般計(jì)稅方式，是依照收取的全部金額計(jì)算納稅，按規(guī)定可以抵減分包款的進(jìn)項(xiàng)稅額，預(yù)繳時(shí)扣除分包款，只是擔(dān)心預(yù)繳過(guò)多以后無(wú)法抵減。此外，預(yù)繳扣減分包款需要分項(xiàng)目操作。

你舉的例子，項(xiàng)目預(yù)繳時(shí)，扣除了分包款，預(yù)繳稅款7.93，機(jī)構(gòu)地申報(bào)時(shí)，按100計(jì)稅，再減去7.93，此時(shí)的7.93并不包括分包款的20，因此需要再減去20的進(jìn)項(xiàng)1.98.

類似于：總包交10，預(yù)繳交6（7-1=6），按規(guī)定最終應(yīng)該交10-6-1=3。其與直接10-7=3的效果是一樣的，只不過(guò)扣除分包款后預(yù)繳，預(yù)繳時(shí)是6，而不是7.

根據(jù)《納稅人跨縣（市）提供建筑服務(wù)增值稅征收管理辦法》第五條規(guī)定，納稅人跨縣（市、區(qū)）提供建筑服務(wù)，按照以下公式計(jì)算應(yīng)預(yù)繳稅款：

（一）適用一般計(jì)稅方法計(jì)稅的，應(yīng)預(yù)繳稅款=(全部?jī)r(jià)

款和價(jià)外費(fèi)用--支付的分包款))÷(1+11%)×2%

（二）適用簡(jiǎn)易計(jì)稅方法計(jì)稅的，應(yīng)預(yù)繳稅款=(全部?jī)r(jià)

款和價(jià)外費(fèi)用--支付的分包款))÷(1+3%)×3%

納稅人取得的全部?jī)r(jià)款和價(jià)外費(fèi)用扣除支付的分包款后的余額為負(fù)數(shù)的，可結(jié)轉(zhuǎn)下次預(yù)繳稅款時(shí)繼續(xù)扣除。

納稅人應(yīng)按照工程項(xiàng)目分別計(jì)算應(yīng)預(yù)繳稅款，分別預(yù)繳。

案例：A省某建筑企業(yè)(一般納稅人)2016年8月分別在B省和C省提供建筑服務(wù)（非簡(jiǎn)易計(jì)稅項(xiàng)目），當(dāng)月分別取得建筑服務(wù)收入（含稅）1665萬(wàn)元和2997萬(wàn)元，分別支付分包款555萬(wàn)元（取得增值稅專用發(fā)票上注明的增值稅額為55萬(wàn)元）和777萬(wàn)元（取得增值稅專用發(fā)票上注明的增值稅額為77萬(wàn)元），支付不動(dòng)產(chǎn)租賃費(fèi)用111萬(wàn)元（取得增值稅專用發(fā)票上注明的增值稅額為11萬(wàn)元），購(gòu)入建筑材料1170萬(wàn)元（取得增值稅專用發(fā)票上注明的增值稅額為170萬(wàn)元）。該建筑企業(yè)在9月納稅申報(bào)期如何申報(bào)繳納增值稅？

該建筑公司應(yīng)當(dāng)在B省和C省就兩項(xiàng)建筑服務(wù)分別計(jì)算

并預(yù)繳稅款：

（1）就B省的建筑服務(wù)計(jì)算并向建筑服務(wù)發(fā)生地主管國(guó)稅機(jī)關(guān)預(yù)繳增值稅。

當(dāng)期預(yù)繳稅款=（1665-555）÷（1+11%）×2%=20萬(wàn)元

（2）就C省的建筑服務(wù)計(jì)算并預(yù)繳增值稅：

當(dāng)期預(yù)繳稅款=（2997-777）÷（1+11%）×2%=40萬(wàn)元

（3）分項(xiàng)目預(yù)繳后，需要回到機(jī)構(gòu)所在地A省向主管國(guó)稅機(jī)關(guān)申報(bào)納稅：

當(dāng)期應(yīng)納稅額=（1665+2997）÷（1+11%）×11%-55-77-11-170=149萬(wàn)元

當(dāng)期應(yīng)補(bǔ)稅額=149-20-40=89萬(wàn)元