我公司自建辦公房產，房產項目在2016年4月30日前動工，房產采用總包方式結算。房產項目從2015年開始至2016年末，想請問我公司取得增值稅專用發(fā)票，該怎樣抵扣？比如總包方采用簡易計稅方法，2016年5月1日之前的房產工程款，我們能不能抵扣增值稅進項稅？2016年5月1日之后的增值稅，是不是可以按兩年（60%，40%）來進行抵扣？
另外為房產項目發(fā)生的工程設計費，又該怎樣抵扣？工程設計費最終會計入在建工程，是不是也需要按兩年（60%，40%）來進行抵扣？工程設計合同簽署時間在2016年4月30日之前，工程設計方分期開具發(fā)票，發(fā)票跨期2016年4月30日前后。
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2016年5月1日之前的支付工程款，按照營業(yè)稅的規(guī)定，對方的納稅義務已經在收到款項時就產生了，因此對方應該給您們開具營業(yè)稅發(fā)票，如果沒有開具營業(yè)稅發(fā)票的話在5月1日之后也只能開具增值稅普通發(fā)票，您們是不能抵扣的。對于5月1日之后開具的增值稅專用發(fā)票，您們是可以抵扣的，按兩年進行抵扣。
《國家稅務總局關于發(fā)布<不動產進項稅額分期抵扣暫行辦法>的公告》（國家稅務總局公告2016年第15號）第三條規(guī)定，納稅人2016年5月1日后購進貨物和設計服務、建筑服務，用于新建不動產，或者用于改建、擴建、修繕、裝飾不動產并增加不動產原值超過50%的，其進項稅額依照本辦法有關規(guī)定分2年從銷項稅額中抵扣。不動產原值,是指取得不動產時的購置原價或作價。
由于您們是新建不動產，因此購進的設計服務需要分2年抵扣。對于設計服務跨期的，按照納稅義務發(fā)生時間確定是否可以開具增值稅專用發(fā)票。如果對方納稅義務屬于可以開具增值稅專用發(fā)票的，則您們可以抵扣。
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