發(fā)票已過180天未抵扣，貴公司重新開具發(fā)票，可能導(dǎo)致重復(fù)繳納增值稅，且第二次開具發(fā)票沒有實際業(yè)務(wù)支持，開具發(fā)票不符合規(guī)定。貴公司需與對方溝通直接憑原發(fā)票入賬，如對方不接受，建議按以下方式操作：

1、與客戶溝通，補償其進項抵扣損失，不再重復(fù)開具發(fā)票。貴公司可以通過下次的交易或者其他方面，給予該客戶補償。該方式貴公司的損失相當(dāng)于重復(fù)繳納了一次增值稅，但不會重復(fù)繳納企業(yè)所得稅，且相關(guān)補償可以抵減企業(yè)所得稅，與此同時，不會違反發(fā)票管理相關(guān)規(guī)定，不存在其他稅務(wù)風(fēng)險。

2、建議客戶按客觀原因為抵扣進項發(fā)票申請抵扣。

建議對方憑國家稅務(wù)總局公告2011年第50號文的規(guī)定申請原發(fā)票抵扣進項，不重復(fù)開具發(fā)票。

根據(jù)國家稅務(wù)總局公告2011年第50號文，買賣雙方因經(jīng)濟糾紛，未能及時傳遞增值稅扣稅憑證，導(dǎo)致增值稅扣稅憑證逾期，屬于一般納稅人發(fā)生真實交易但由于客觀原因造成增值稅扣稅憑證逾期的，經(jīng)主管稅務(wù)機關(guān)審核、逐級上報，由國家稅務(wù)總局認證、稽核比對后，對比對相符的增值稅扣稅憑證，允許納稅人繼續(xù)抵扣其進項稅額。

如能按上述文件操作，則對方可以憑原發(fā)票抵扣進項，不需要貴公司再次開具發(fā)票。但該方式的要求逐級上報至總局，操作難度較大，且后續(xù)發(fā)布的國家稅務(wù)總局公告2011年第78號規(guī)定的可以抵扣的范圍不包括買賣雙方因經(jīng)濟糾紛的情形。