一、根據(jù)《中華人民共和國(guó)個(gè)人所得稅法》第八條規(guī)定，個(gè)人所得稅，以所得人為納稅義務(wù)人，以支付所得的單位或者個(gè)人為扣繳義務(wù)人。如上所述，C企業(yè)的股權(quán)轉(zhuǎn)讓款項(xiàng)支付對(duì)象是A有限合伙企業(yè)，而非A有限合伙企業(yè)的自然人股東，因此不負(fù)有代扣代繳個(gè)人所得稅義務(wù)。（《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于〈關(guān)于個(gè)人獨(dú)資企業(yè)和合伙企業(yè)投資者征收個(gè)人所得稅的規(guī)定〉執(zhí)行口徑的通知》規(guī)定，個(gè)人獨(dú)資企業(yè)和合伙企業(yè)對(duì)外投資分回的利息或者股息、紅利，不并入企業(yè)的收入，而應(yīng)單獨(dú)作為投資者個(gè)人取得的利息、股息、紅利所得，按‘利息、股息、紅利所得’應(yīng)稅項(xiàng)目計(jì)算繳納個(gè)人所得稅。以合伙企業(yè)名義對(duì)外投資分回利息或者股息、紅利的，應(yīng)按《關(guān)于印發(fā)〈關(guān)于個(gè)人獨(dú)資企業(yè)和合伙企業(yè)投資者征收個(gè)人所得稅的規(guī)定〉的通知》（財(cái)稅[2000]91號(hào)）規(guī)定的第五條精神確定各個(gè)投資者的利息、股息、紅利所得，分別按‘利息、股息、紅利所得’應(yīng)稅項(xiàng)目計(jì)算繳納個(gè)人所得稅。但這里是股權(quán)轉(zhuǎn)讓所得，而非利息股息紅利所得，因此不適用此規(guī)定。）

二、A有限合伙企業(yè)取得該筆股權(quán)轉(zhuǎn)讓款，應(yīng)當(dāng)并入該合伙企業(yè)，一并計(jì)算生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)所得。（《關(guān)于印發(fā)〈關(guān)于個(gè)人獨(dú)資企業(yè)和合伙企業(yè)投資者征收個(gè)人所得稅的規(guī)定〉的通知》（財(cái)稅[2000]91號(hào)）第四條：收入總額，是指企業(yè)從事生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)以及與生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)有關(guān)的活動(dòng)所取得的各項(xiàng)收入，包括商品（產(chǎn)品）銷售收入、營(yíng)運(yùn)收入、勞務(wù)服務(wù)收入、工程價(jià)款收入、財(cái)產(chǎn)出租或轉(zhuǎn)讓收入、利息收入、其他業(yè)務(wù)收入）

合伙企業(yè)的投資者按照合伙企業(yè)的全部生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)所得和合伙協(xié)議約定的分配比例確定應(yīng)納稅所得額，合伙協(xié)議沒(méi)有約定分配比例的，以全部生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)所得和合伙人數(shù)量平均計(jì)算每個(gè)投資者的應(yīng)納稅所得額。所稱生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)所得，包括企分配給投資者個(gè)人的所得和企業(yè)當(dāng)年留存的所得（利潤(rùn)）。即合伙企業(yè)本身不是所得稅納稅人，而應(yīng)當(dāng)由其合伙人按照“先分后稅”原則分別繳納。

投資者個(gè)人的生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)所得，比照個(gè)人所得稅法的“個(gè)體工商戶的生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)所得”應(yīng)稅項(xiàng)目，按年計(jì)算，分月預(yù)繳，由納稅義務(wù)人在次月十五日內(nèi)預(yù)繳，年度終了后三個(gè)月內(nèi)匯算清繳，多退少補(bǔ)。