A有限責(zé)任公司由兩位自然人持股，主要資產(chǎn)是一幢不動產(chǎn)，現(xiàn)在計劃分立。在條件都符合59號文的情況下，被分立公司企業(yè)所得稅適用特殊性稅務(wù)處理。

那么問題來了：自然人持股公司適用特殊性稅務(wù)處理嗎？自然人股東應(yīng)該在分立后視同分配或清算而繳納股息紅利個人所得稅嗎？

企業(yè)分立，可以視為被分立企業(yè)將需要分立的資產(chǎn)以減資的形式分配給現(xiàn)有股東，股東再用分得的資產(chǎn)注冊設(shè)立一家新企業(yè)。

重組交易中，股權(quán)收購中轉(zhuǎn)讓方、合并中被合并企業(yè)股東和分立中被分立企業(yè)股東，可以是自然人。當(dāng)事各方中的自然人應(yīng)按個人所得稅的相關(guān)規(guī)定進(jìn)行稅務(wù)處理。在存在自然人股東的情況下，并不影響被分立企業(yè)適用企業(yè)所得稅特殊性稅務(wù)處理。

假設(shè)按照該分離資產(chǎn)的計稅基礎(chǔ)X作價分配給現(xiàn)存自然人股東，自然人股東持有被分立企業(yè)減資部分對應(yīng)的股權(quán)的計稅基礎(chǔ)Y，如果X＞Y，差額按照股權(quán)轉(zhuǎn)讓所得由自然人股東繳納20%的個人所得稅。

自然人股東按照計稅基礎(chǔ)X取得減資分配的資產(chǎn)后，再按照公司法規(guī)定的評估值Z出資設(shè)立分立企業(yè)，Z大于X的部分屬于非貨幣性資產(chǎn)出資發(fā)生的增值，需要繳納個人所得稅，但可以按規(guī)定適用分期納稅。

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