一、正常來(lái)說(shuō)銷售方因質(zhì)量問(wèn)題向購(gòu)貨方賠償，應(yīng)按如下方式處理：

《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于修訂的通知》（國(guó)稅發(fā)[2006]156號(hào)）第十四條規(guī)定，一般納稅人取得專用發(fā)票后，發(fā)生銷貨退回、開票有誤等情形但不符合作廢條件的，或者因銷貨部分退回及發(fā)生銷售折讓的，購(gòu)買方應(yīng)向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)填報(bào)《開具紅字增值稅專用發(fā)票申請(qǐng)單》（以下簡(jiǎn)稱《申請(qǐng)單》，附件3）。

《申請(qǐng)單》所對(duì)應(yīng)的藍(lán)字專用發(fā)票應(yīng)經(jīng)稅務(wù)機(jī)關(guān)認(rèn)證。

第十六條規(guī)定，主管稅務(wù)機(jī)關(guān)對(duì)一般納稅人填報(bào)的《申請(qǐng)單》進(jìn)行審核后，出具《開具紅字增值稅專用發(fā)票通知單》（以下簡(jiǎn)稱《通知單》，附件4）。《通知單》應(yīng)與《申請(qǐng)單》一一對(duì)應(yīng)。

第十八條規(guī)定，購(gòu)買方必須暫依《通知單》所列增值稅稅額從當(dāng)期進(jìn)項(xiàng)稅額中轉(zhuǎn)出，未抵扣增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額的可列入當(dāng)期進(jìn)項(xiàng)稅額，待取得銷售方開具的紅字專用發(fā)票后，與留存的《通知單》一并作為記賬憑證。屬于本規(guī)定第十四條第四款所列情形的，不作進(jìn)項(xiàng)稅額轉(zhuǎn)出。

第十九條規(guī)定，銷售方憑購(gòu)買方提供的《通知單》開具紅字專用發(fā)票，在防偽稅控系統(tǒng)中以銷項(xiàng)負(fù)數(shù)開具。

根據(jù)上述規(guī)定，銷售貨物后，向購(gòu)買方支付的質(zhì)量索賠款，實(shí)質(zhì)上屬于發(fā)生銷售折讓，購(gòu)買方應(yīng)向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)填報(bào)《開具紅字增值稅專用發(fā)票申請(qǐng)單》，銷售方憑購(gòu)買方提供的《通知單》開具紅字專用發(fā)票，在防偽稅控系統(tǒng)中以銷項(xiàng)負(fù)數(shù)開具。

二、如不能上述方式處理，你司收到賠償因不屬于銷售行為，因此，談不上價(jià)外費(fèi)問(wèn)題，也不涉及流轉(zhuǎn)稅，但需要計(jì)入應(yīng)納稅所得額，有所得稅問(wèn)題。

三、存貨損失所得稅前扣除規(guī)定如下：

根據(jù)《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于商業(yè)零售企業(yè)存貨損失稅前扣除問(wèn)題的公告》（國(guó)家稅務(wù)總局公告2014年第3號(hào)）規(guī)定：一、商業(yè)零售企業(yè)存貨因零星失竊、報(bào)廢、廢棄、過(guò)期、破損、腐敗、鼠咬、顧客退換貨等正常因素形成的損失，為存貨正常損失，準(zhǔn)予按會(huì)計(jì)科目進(jìn)行歸類、匯總，然后再將匯總數(shù)據(jù)以清單的形式進(jìn)行企業(yè)所得稅納稅申報(bào)，同時(shí)出具損失情況分析報(bào)告。二、商業(yè)零售企業(yè)存貨因風(fēng)、火、雷、震等自然災(zāi)害，倉(cāng)儲(chǔ)、運(yùn)輸失事，重大案件等非正常因素形成的損失，為存貨非正常損失，應(yīng)當(dāng)以專項(xiàng)申報(bào)形式進(jìn)行企業(yè)所得稅納稅申報(bào)。三、存貨單筆（單項(xiàng)）損失超過(guò)500萬(wàn)元的，無(wú)論何種因素形成的，均應(yīng)以專項(xiàng)申報(bào)方式進(jìn)行企業(yè)所得稅納稅申報(bào)。四、本公告適用于2013年度及以后年度企業(yè)所得稅納稅申報(bào)?！?/p>

商業(yè)零售企業(yè)存貨損失的企業(yè)所得稅稅前扣除按照上述文件規(guī)定處理，適用于2013年度及以后年度企業(yè)所得稅納稅申報(bào)。

據(jù)此，建議做專項(xiàng)申報(bào)處理。