按照問題描述，如取得增值稅專用發(fā)票，可以抵扣進項。建議與客戶協(xié)商完善業(yè)務模式。

貴公司為客戶提供加工服務，同時客戶派人到現(xiàn)場配合做產(chǎn)品質(zhì)量管理，向貴公司收取服務費，按規(guī)定向貴公司開具服務費發(fā)票，即當成兩項業(yè)務處理。

即：業(yè)務一，貴公司收取加工費，假設為100，貴公司向客戶開具100元的增值稅專用發(fā)票，按17%繳納增值稅；業(yè)務二，客戶派員向貴公司提供管理服務，按服務納稅（應該是按6%繳納增值稅，問題所述20%，請詳細說明），假設服務費20元（不是問題所述工資，因為該人員不是貴公司員工），對方案20元向貴公司開具發(fā)票。該情況下，對方如向貴公司開具增值稅專用發(fā)票，可以作為貴公司的費用支出抵扣進項稅額，如只開具收據(jù)，增值稅不能抵扣、企業(yè)所得稅也無法列支費用。

為減少總體稅務成本，建議貴公司與客戶協(xié)商，直接調(diào)低貴公司的加工費，即在合同當中約定，貴公司為該客戶提供加工服務，客戶除了提供主要料件之外，還需要負責產(chǎn)品質(zhì)量的監(jiān)督問題（派員進駐加工廠方式），但加工費由之前的100元調(diào)整為80元（即100-20=80元），該情況下，貴公司實際收取的加工費為80元，按80元向客戶開具加工費發(fā)票，對方聘請人員監(jiān)督產(chǎn)品質(zhì)量，與貴公司無關。

如果負責質(zhì)量監(jiān)督的人員不是客戶的員工，是第三方，也可以考慮調(diào)減加工費，該項費用直接由客戶自己承擔。